বেফাকুল মাদারিসিল আরাবিয়া বাংলাদেশ (বেফাক)-এর শীর্ষ নেতৃত্বে গঠনতন্ত্র লঙ্ঘনের অভিযোগ তুলেছেন বোর্ডের সহ-সভাপতি ও আল-জামিয়াতুল ইমদাদিয়া কিশোরগঞ্জের প্রিন্সিপাল মাওলানা শাব্বির আহমাদ রশিদ। এক বার্তায় তিনি বেফাকের বর্তমান সংকটের চিত্র তুলে ধরেন।

বেফাকের সভাপতি ও মহাসচিবের সরাসরি রাজনীতিতে যুক্ত হওয়া নিষিদ্ধ থাকলেও বর্তমান মহাসচিব একটি নির্দিষ্ট দলের মিছিলে নেতৃত্ব দিচ্ছেন।

নেতৃত্বের এই রাজনৈতিক ভূমিকার কারণে চরমোনাই মাদরাসাগুলো আলাদা বোর্ড গঠনের জন্য সরকারের কাছে আবেদন করতে চাইছে। ক্ষোভ বাড়ছে জমিয়ত সংশ্লিষ্টদের মাঝেও।

​মাওলানা রশিদ আশঙ্কা প্রকাশ করেছেন যে, বেফাকের বিশাল তহবিল, ব্যাংক ব্যালেন্স ও প্রকাশনা আয়ের ওপর একটি মহলের নজর পড়েছে, যারা বোর্ডটি ভেঙে কর্তৃত্ব নিতে চায়।

তিনি সতর্ক করে বলেন, সঠিক নেতৃত্বের অভাবে কওমি ছাত্ররা ধীরে ধীরে মওদুদী মতবাদের প্রতি নমনীয় হয়ে পড়ছে।

​পরিশেষে, তিনি মুফতি জাফর আহমদ ও মাওলানা শওকতসহ জ্যেষ্ঠ সদস্যদের এগিয়ে আসার আহ্বান জানান এবং বেফাককে ফিতনামুক্ত রাখতে বর্তমান সভাপতিকে নিয়মের ওপর অনড় থাকার পরামর্শ দেন।